02/2025~現在 中國科學院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院，數字生物醫(yī)學研究中心，客座研究員?
01/2019~現在 中國科學院自動化研究所，計算生物學與機器智能團隊，PI
01/2019~現在 中國科學院大學，人工智能學院，長聘教授
01/2019~現在 中國科學院自動化研究所，多模態(tài)人工智能系統(tǒng)全國重點實驗室（原模式識別國家重點實驗室），研究員
07/2014~12/2018 美國卡內基梅隆大學，生物醫(yī)學工程系和計算生物學系，副教授
01/2009~12/2018 美國卡內基梅隆大學-匹茲堡大學計算生物學聯合博士項目，教師
01/2009~06/2014 美國卡內基梅隆大學，生物醫(yī)學工程系和計算生物學系，助理教授
01/2004-12/2008 計算生物學專業(yè)博士后，美國加利福尼亞斯州克利普斯研究所
10/2001-02/2004 機械工程專業(yè)（機器人學）博士，輔修：應用數學， 美國明尼蘇達大學雙城分校
12/1998-10/2001 機械工程專業(yè)（機器人學）碩士，美國明尼蘇達大學雙城分校
09/1995-07/1998 自動控制專業(yè)（機器人學）碩士，中國科學院自動化研究所
09/1986-07/1991 汽車工程和自動控制 雙學士，清華大學
楊戈博士，2004年獲美國明尼蘇達大學機械工程（機器人學）博士學位。2004-2008年在美國加州斯克里普斯研究所完成計算生物學博士后，2009-2018在美國卡內基梅隆大學生物醫(yī)學工程系和計算生物學系任助理教授和副教授。2019年入選中國科學院杰出海外人才（A類）引進計劃，全職回國任中國科學院自動化研究所多模態(tài)人工智能系統(tǒng)全國重點實驗室研究員，中國科學院大學人工智能學院長聘教授，博士生導師。2025年起任中國科學院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院客座研究員。曾獲美國國家科學基金早期研究生涯(EARLY?CAREER)獎，國際生物醫(yī)學圖像會議(ISBI)最佳論文獎等。目前已在國際知名學術期刊如Nature Cell Biology，Nature Communications, Cell Research, Journal of Cell Biology，PNAS, Cell Reports, Bioinformatics等和人工智能領域高水平會議如ICCV, ECCV，AAAI, ICLR，MICCAI等發(fā)表論文近100篇。主持國家自然科學基金委員會細胞器互作重大研究計劃重點項目，工信部數字細胞國家重點研發(fā)項目，中國科學院生物大分子結構與功能戰(zhàn)略性先導科技專項和數字細胞先導科技專項等多個國家級研究項目。
研究方向：人工智能，計算生物學，數字細胞大模型，生物醫(yī)學圖像處理
（1）全細胞尺度細胞器互作網絡時空圖譜繪制與分析,?主持,?國家自然科學基金重大專項集成項目, 2024-01--2025-12
（2）基于深度學習的生物熒光顯微圖像分割關鍵技術研究與應用,?主持,?國家自然科學基金面上項目, 2020-01--2023-12
（3）全細胞尺度溶酶體空間分布與互作調控的計算分析與建模,?主持,?國家自然科學基金重大專項重點項目, 2020-01--2023-12
（4）生物大分子跨尺度結構研究的大數據深度學習整合分析技術,?主持,?中國科學院戰(zhàn)略性先導計劃子課題, 2020-01--2024-12
2020 ?中國科學院大學優(yōu)秀教師獎
2019 ?中國科學院杰出海外人才（A類）
2015 ?國際電工電子學會生物醫(yī)學圖像會議（ISBI）最佳論文獎
2014 ?國際圖像物體計算模型會議最佳論文獎
2014 ?卡內基梅隆大學伯克曼教師發(fā)展獎
2012 ?美國國家科學基金早期研究生涯（EARLY CAREER）獎
1)?Xiaodong Yang, Guole Liu, Guihai Feng, ..., Ge Yang*, Xin Li*, GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model, Cell Research, 34(12):830-845,2024. （*：Corresponding authors）?
2)?Jiaxing Huang, Yaoru Luo, Yuanhao Guo, Wenjing Li, Zichen Wang, Guole Liu, Ge Yang, Accurate segmentation of intracellular organelle networks using low-level features and topological self-similarity. Bioinformatics. 40(10):btae559, 2024. ??
3)?Jiaxing Huang, Yanfeng Zhou, Yaoru Luo, Guole Liu, Heng Guo & Ge Yang, Representing Topological Self-similarity Using Fractal Feature Maps for Accurate Segmentation of Tubular Structures, European Conference on Computer Vision?(ECCV), pp. 143-160, 2024.?
4)?Guole Liu, Tongxin Niu, Qiu M, Zhu Y, Sun F, Yang G. DeepETPicker: Fast and accurate 3D particle picking for cryo-electron tomography using weakly supervised deep learning. Nature Communications. 15(1):2090， 2024.?
5)?Yanfeng Zhou, Lingrui Li, Chenlong Wang, Le Song and Ge Yang, "GobletNet: Wavelet-Based High-Frequency Fusion Network for Semantic Segmentation of Electron Microscopy Images," in IEEE Transactions on Medical Imaging, 44(2):1058-1069, 2024.?
6)?Zhang Y. and Yang G. A motion transformer for single particle tracking in fluorescence microscopy images, 2023 Internation Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), pp. 503-513， 2023.?
7)?Zhou Y., Huang J., Wang C., Song L. and Yang G. Xnet: Wavelet-based low and high frequency fusion networks for fully- and semi-supervised semantic segmentation of biomedical images, IEEE International Conference on Computer Vision (ICCV), 21085-21096， 2023.?
8)?Zhu K., Hu X., Wang J., Xie X. and Yang G. Improving generalization of adversarial training via robust critical fine-tuning, IEEE International Conference on Computer Vision (ICCV), 4424-4434，2023.?
9)?Luo Y., Liu G., Li W., Guo Y., and Yang G. (2022) Deep neural networks learn meta-structure to segment fluorescence microscopy images, AAAI Conference on Artificial Intelligence?(AAAI), 36(2), 1908-1916?(oral presentation).?
10)?Guo Y., Shen D., Zhou Y., Yang Y., Liang J., Zhou Y., Li N., Liu Y., Yang G.*, and Li W.* Deep learning-based morphological classification of endoplasmic reticulum under stress, Frontiers in Cell and Developmental Biology, ?9:767866, 2022.
